Contacto l Ayuda l Mapa del sitio 

  Español Inglés

Presentación Base Molecular Registro HA Registro HB Estadísticas Contribuciones Enlaces

 

Ayuda

Acerca de la numeración de las mutaciones

 

Registro Hemofilia A

La numeración empleada es idéntica a la empleda en la base de datos internacional de mutaciones en Hemofilia A (HAMSTeRS) con el fin de facilitar la comparación entre ambas, así como con la  mayoria de las publicaciones.

Los nucleótidos están numerados a partir de la molecula de mRNA del Factor VIII correspondiendo la adenina (A) del codón de origen de traducción (ATG) a la posición numero 1.

Los residuos de la proteína están numerados de acuerdo con los residuos presentes en la proteína madura. Es decir, los 19 residuos del péptido señal se numeran de forma negativa correspondiendo a la metionina inicial la posición número -19.

A partir de un nucleótido determinado se puede calcular el residuo afectado aplicando  la fórmula:

Entero de [(número de nucleótido/3)-19]

 

Registro Hemofilia B

La numeración empleada es idéntica a la empleda en la base de datos internacional de mutaciones en Hemofilia B (Haemophilia B Mutation Database) con el fin de facilitar la comparación entre ambas, así como con la mayoria de las publicaciones.

Los nucleótidos están numerados de acuerdo con la posición en el gen del Factor IX correspondiendo la adenina (A) del origen de transcripción a la posición numero 1.

Los residuos de la proteína están numerados de acuerdo con los residuos presentes en la proteína madura. Es decir, los 46 residuos del péptido señal se numeran de forma negativa correspondiendo a la metionina inicial la posición número -46.

 

Acerca de la nomenclatura de las mutaciones

 

La nomenclatura utilizada en el registro se basa en las recomendaciones propuestas por el Nomenclature Working Group cuya misión es la de establecer una sistemática en la denominación de las mutaciones en genes humanos.

 

Tenga en cuenta las siguientes consideraciones a la hora de buscar o consultar las mutaciones específicas de los genes:

  • Las sustituciones comienzan con el número del nucleótido afectado seguido del cambio producido. 854A>C denota que, en el nucleótido 854 de la secuencia de referencia, A es substituida por una C.

  • Las deleciones son indicadas mediante del después del número del nucleótido. 6174delT denota la deleción de T en el nucleótido 6174 de la secuencia de referencia. 6503delTT denota la deleción de 2 nucleótidos a partir del nucleótido 6503.

  • Las inserciones son indicadas mediante ins después del número del  nucleótido. 5677insA denota la inserción de una  A después del nucleotide 5677.

  • Las mutaciones en intrones, cuando la secuencia genómica completa no se conoce, se indican mediante el número del intrón (IVS), números positivos que empiezan con G dinucleótido invariante GT de la secuencia de splicing , los números negativos que empiezan con el G del aceptador local AG invariante. IVS62+1G>A indica la sustitución de G a A en el nucleótido +1 del intrón 62. IVS4-2A>C denota la substitución de A a C en el nucleótido -2 del intron 4. Cuando se conoce la secuencia genómica completa del gen, la mutación se indica mediante el número del nucleótido de la secuencia de referencia.

  • Para la nomenclatura de los aminoácidos, el formato es R1443G (arginina en el codón 1443 sustituido por glicina). El aminoácido "tipo salvaje" se indica antes del número del codón y el aminoácido del mutante después.  En algunos casos, sin embargo, la mutación también se da como Arg1443Gly.

  • Los codones de parada son indicados mediante X. Por ejemplo E1250X indica que el ácido glutámico en posición 1250 es substituido por un codón de parada.

 

Para obtener información adicional acerca de la  nomenclatura recomendada en mutaciones más complejas, consulte por favor los artículos siguientes:

 

Nomenclature for the description of human sequence variations

Hum Genet. 2001 Jul;109(1):121-4.

 

Mutation nomenclature extensions and suggestions to describe complex mutations: a discussion

Hum Mutat. 2000;15(1):7-12.

 

   

© Hemobase.com 2010